染色質的修飾對于調節(jié)幾乎所有以 DNA 為模板的生物過程至關重要。  單細胞染色質修飾譜可用于評估染色質修飾，這可以提供表觀遺傳變化和生理變化之間的關系。

染色質修飾

染色質修飾是通過共價組蛋白修飾和核小體修飾實現的。 組蛋白 乙?；?、去乙?；⒓谆土姿峄枪矁r組蛋白修飾的形式，由組蛋白乙酰轉移酶 (HAT)、組蛋白去乙?；?(HDAC)、組蛋白甲基轉移酶 (HNMT) 和激酶等酶進行。 由 DNA 甲基轉移酶 (DNMT) 進行的 DNA 甲基化和由激酶進行的 DNA 磷酸化是核小體修飾的形式。 染色質重塑對于調節(jié)基因表達和其他調節(jié)過程很重要，例如卵細胞 DNA 復制和修復、細胞凋亡和染色體分離。

染色質修飾分析的類型

染色體免疫沉淀測序

染色體免疫沉淀測序 (ChIP-seq) 可以分析蛋白質與 DNA 的相互作用，并提供有關表觀遺傳變化的信息。  ChIP-seq實驗服務涉及將蛋白質與 DNA 交聯，然后通過超聲處理進行 DNA 片段化。  然后添加珠連接抗體以免疫沉淀靶蛋白。

染色質免疫沉淀定量PCR分析

染色質免疫沉淀定量 PCR 分析 (ChIP-qPCR) 可用于評估已知基因組結合位點的蛋白質-DNA 相互作用。  當位點未知時，可以針對潛在的調控區(qū)域（例如啟動子）設計 qPCR 引物。   ChIP-qPCR 具有與標準 ChIP-qPCR 非常相似的程序，但在 ChIP-qPCR 實驗結束時，得到的 DNA 會進行 qPCR，然后進行分析。

輝駿生物提供的ChIP染色質免疫共沉淀服務分為以下兩種：

1. ChIP qPCR實驗，用于檢測某樣本中的誘餌蛋白和待測DNA片段是否結合；

2. ChIP seq實驗，用于篩選某樣本中的誘餌蛋白可以結合哪些DNA區(qū)域。

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ChIP服務優(yōu)勢*輝駿生物

質譜

質譜流式細胞儀結合了流式細胞儀和質譜儀，用于辨別細胞的特性。  抗體與純元素結合，用于標記細胞蛋白。  然后將細胞霧化并通過氬等離子體將抗體電離。  產生的金屬信號由質譜儀分析。  該方法用于分析染色質修飾。

LC-MS/MS蛋白質譜鑒定應用范圍

★IP，Co-IP，Pull-down類蛋白相互作用樣本（膠條或溶液）的鑒定；

★細胞器，外泌體等簡單樣本中的所有表達蛋白質的鑒定（全譜分析）。

LC-MS/MS質譜鑒定服務信息-輝駿生物

使用染色質修飾 Pprofiling 進行的發(fā)現

老化

最近，隨著年齡的增長，觀察到表觀遺傳變異的數量增加。   多重質譜流式分析用于在單細胞水平上分析原代人類免疫細胞中染色質修飾的水平。   對年輕人和老年人進行了差異分析，結果表明，衰老表明個體之間的異質性增加，染色質修飾的細胞間變異性增加。  這些發(fā)現顯示了年齡對染色質修飾的影響。

乳腺癌

在乳腺癌模型的惡性轉化過程中發(fā)現了表觀遺傳變化。通過在乳腺上皮細胞中表達三種癌基因來制作乳腺癌模型。  進行了 ChIP 分析，然后進行了組蛋白甲基化的下一代測序。   使用蛋白質印跡、定量逆轉錄酶 PCR (qRT-PCR) 和免疫染色來確定基因表達。   該研究發(fā)現，在乳腺癌模型中，參與抑制某些癌基因的兩個組蛋白標記減少了。

免疫抑制

SUMOylation 是一種轉錄后修飾，涉及各種細胞過程，例如轉錄調節(jié)、細胞凋亡、蛋白質穩(wěn)定性和細胞周期進程。  人類有 3 種 SUMO 蛋白（SUMO-1 和 SUMO-2/3）。  一項研究發(fā)現，皰疹病毒（卡波西肉瘤相關皰疹病毒 (KSHV)）已經進化出直接和間接調節(jié) SUMO 機制以避免宿主免疫系統(tǒng)的機制。  進行的 ChIP-seq 實驗發(fā)現 KSHV 重新激活后 SUMO-2/3 顯著增加。   基因本體分析發(fā)現了參與細胞免疫反應和細胞因子信號傳導的基因。  KSHV 通過增加 SUMO-2/3 的轉錄以阻礙免疫反應來避免免疫系統(tǒng)。

結論

染色質修飾的分析使我們能夠更好地了解某些生物過程和疾病。  進一步的研究將提供更多關于有益染色質變化的知識。